Történet

Húsz éve annak, hogy a második ninja háború kezdetét vette. Rengeteg veszteség érte Virág rejtett faluját, és az összes többi ninja nemzedéket. Négy éve A Föld rejtett falujának Hokageja és A Virág rejtett falujának Hokageja olyasfajta döntést hozott, hogy megalkottja a ,,Juushi-su''(erő-rejtek) pecsétjét, amely az egymás fölötti uralkodási jogot és hatalmat egy kis üvegcsébe zárja. Ennek köszönhetően semelyik falu nem törhetett uralomra. Az üvegben lévő mágikus erő két irányba fordítható: az örök béke, vagy a zsarnokság felé. Az a falu vezethette a többi falut, akinek a birtokában van a Ryuusei Hana(hullócsillag virága),melynek holléte rejtély, hisz ezt az üvegcsét a két Hokage saját maguk feláldozásával a Nyugalom szigetére rejtette. Ezt a szigetet csak ők tudhatták hol van, de halálukkal végül a sírba vitték a titkot.

          Mostanság a harcok a Ryuusei Hana-ért folynak, mindenki információkat gyűjt, és próbálja kideríteni annak hollétét. A falvak szövetségeseket gyűjtöttek, és kisebb-nagyobb csatákat vívtak a környező ellenséges falvakkal. 

    Virág falu újra kivirágzott a háború után, és újra gyűltek a kis ninjatanoncok az Akadémián. Kisebb-nagyobb sikerrel, dicsérésre méltő Geninek, Chuuninok és Jouninok hagyták el a falvat különböző küldetések okából. Amane-sama Virág rejtek bölcs Hokageja lett. A háború kezdetén ő is kitartóan harcolt. Akik akkor még csak diákok voltak, ma már sensei-ekké léptek elő ha alkalmasnak bizonyultak. Persze akadt olyan is, akit elcsábított a sötétség.

        Ninjáink lelkesen tanulnak és készülnek a vizsgákra. A geninné válás sikeresen végződött, bár hátra vannak a küldetések, melyek sok izgalmat és kalandot hagynak maguk után és persze hátra van a Chuunin vizsga is, ám ennek a végén egy olyan katasztrófa történik, amelyre senki sem számított, és gyökeresen megváltoztatja az összes falu sorsát és életét...